Introdução: O receptor nuclear X retinoide (RXR) é uma família de fatores de transcrição que desempenha um papel essencial no desenvolvimento do coração. Enquanto a deleção sistêmica de RXRα causa letalidade embrionária devido a defeitos cardíacos, a contribuição funcional do RXR específica para o metabolismo cardíaco ainda não foi explorada. Objetivo: Comparar as diferenças no metabolismo de corações de camundongos adultos e neonatos com e sem deleção do RXR. Métodos: A deleção de RXRαβ foi induzida e as diferenças no metabolismo de corações de camundongos adultos e neonatos foram avaliadas em comparação com corações de camundongos do tipo selvagem, utilizando uma abordagem metabolômica non-targeted com cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas (CG-EM). Corações adultos e todo o órgão do recém-nascido (5 mg em média) congelados foram homogeneizados para análise. O homogenato foi processado para desproteinização, derivatização, extração dos metabólitos e analisado por GC-EM. Os dados brutos foram desconvoluídos, alinhados e integrados, e os metabólitos foram identificados por comparação de espectros de fragmentação com bancos de dados validados. A matriz de dados foi exportada para filtração, normalização, dimensionamento e posterior análise estatística univariada e multivariada. Para todas análises foi adotado nível de significância de 5%. Resultados: A deleção do RXR em corações de animais adultos apresentaram maiores concentrações de colesterol, uracil, serina, glicose, manose e menores concentrações de adenosina quando comparado aos corações de adultos selvagens (p < 0,001, p < 0,001, p = 0,004, p = 0,006, p = 0,017 e p = 0,033, a cada metabólito respectivamente). No entanto, o metabolismo cardíaco nos animais neonatos com deleção do RXR apresentaram menores concentrações de glicerol e maiores níveis de ácido aspártico, uracil e creatinina, comparado aos neonatos sem a deleção (p = 0,007, p = 0,025; p = 0,028 e p = 0,040, a cada metabólito respectivamente). Conclusão: A deleção do RXR proporciona modificações metabólicas distintas entre adultos e neonatos. Alterações sutis no metabolismo do RXR podem estar atreladas a algumas disfunções miocárdicas observadas na fase adulta.